2015

• 研討會   植物醫學教育之未來展望, 植物保護教育40周年回顧與展望研討會, 屏東, 中華民國

2013

• 專書   鄭秋雄*, 綠豆黃化嵌紋病毒之研究：基因組DNA之分子選殖及其感染力(Studies on Mung Bean Yellow Mosaic Virus－Molecular Cloning of Viral Genomic DNA and Its Infectivity), 日本東京農業大學博士論文, 0, ISBN: 平裝

2012

• 研討會   鄭秋雄*, 溫敏琪, 陳維霖, 培植體、置床方式與植物生長調節劑對番石榴微體繁殖之影響, 台灣園藝學會2012年年會論文宣讀, 國立嘉義大學, 中華民國
• 研討會   鄭秋雄*, 張雅嵐, 袁琴雅, 李欣穎, 癒傷組織之鮮重、誘導方式及調整培養基對水稻懸浮細胞培養之影響, 台灣園藝學會2012年年會論文宣讀, 國立嘉義大學, 中華民國
• 研討會   鄭秋雄*, 張雅嵐, 袁琴雅, 2,4-D 含量、置床方式及去胚乳對誘導水稻種子癒傷組織之影響, 台灣園藝學會2012年年會論文宣讀, 國立嘉義大學, 中華民國
• 研討會   鄭秋雄*, 何耀順, 培植體與植物生長調節劑對綠竹微體繁殖之影響, 台灣園藝學會2012年年會論文宣讀, 國立嘉義大學, 中華民國

2011

• 期刊   鄭秋雄*, 溫敏琪, 陳維霖, 培植體、置床方式與植物生長調節劑對番石榴微體繁殖之影響, 臺灣園藝, 臺灣園藝學會 , 57, 4, 304-304
• 期刊   鄭秋雄*, 張雅嵐, 袁琴雅, 李欣穎, 癒傷組織之鮮重、誘導方式及調整培養基對水稻懸浮細胞培養之影響, 臺灣園藝, 臺灣園藝學會, 57, 4, 304-304
• 期刊   鄭秋雄*, 張雅嵐, 袁琴雅, 2,4-D 含量、置床方式及去胚乳對誘導水稻種子癒傷組織之影響, 臺灣園藝, 臺灣園藝學會 , 57, 4, 303-303
• 期刊   鄭秋雄*, 何耀順, 培植體與植物生長調節劑對綠竹微體繁殖之影響, 臺灣園藝, 臺灣園藝學會 , 57, 4, 303-303
• 專書   鄭秋雄*, 江友中, 王均琍, 國立屏東科技大學農學院叢書 008 植物學實驗, 國立屏東科技大學農學院, 6, ISBN: 978-986-02-8266-5

2009

• 研討會   鄭秋雄*, 呂理佑, 官重余, 利用植物粗汁液抑制小花蔓澤蘭種子發芽之初探, 中華民國雜草學會九十八學年度年會雜草科學講座暨研究成果發表會WEED SCIENCE BULLETIN, 國立台灣大學農藝學系, 中華民國, 154-154
• 期刊   鄭秋雄*, 呂理佑, 官重余, 利用植物粗汁液抑制小花蔓澤蘭種子發芽之初探, 中華民國雜草學會學刊, 中華民國雜草學會, 30, 2, 154-154

2008

• 專書   鄭秋雄*, 蔡顓印, 水稻台?九號癒傷組織及細胞培養之研發及其應用, 國立屏東科技大學熱帶農業暨國際合作系所, 0, ISBN: 平裝

2007

• 專書   鄭秋雄*, 許馨云, 以白葉枯病菌培養過濾液誘導台?九號抗病株之篩選, 國立屏東科技大學植物保護系所, 0, ISBN: 平裝

2004

• 研討會   鄭秋雄*, 許馨云, 羅月慧, 葉序、葉塊培植體來源及置床方式對誘導茄子癒傷組織之影響, 植物生技產業應用研討會論文集, 國立屏東科技大學, 中華民國, 545-555

2001

• 研討會   鄭秋雄*, 利用細胞培養技術進行抗青枯病番茄育種, 財團法人中正農業科技社會公益基金會九十年研究計畫成果研討會專刊 , 中華民國, 21-30

2000

• 期刊   鄭秋雄*, 黃偉洲, 文心蘭無病種苗大量繁殖技術之研發, 中國園藝, 臺灣園藝學會, 45, 4, 474-474
• 期刊   鄭秋雄*, 王淑貞, 洪宜君, 番茄癒傷組織之誘導及懸浮細胞培養, 中國園藝, 臺灣園藝學會, 45, 4, 473-473
• 期刊   鄭秋雄*, 徐振權, 林美娟, 番茄癒傷組織誘導培養, 中國園藝, 臺灣園藝學會, 46, 4, 508-508
• 期刊   鄭秋雄*, 生物科技專題講座－生物技術在農業上的應用, 科技博物, 科學工藝博物館, 4, 4, 105-110
• 期刊   鄭秋雄*, 木瓜原生質體之分離及植株再生, 中國園藝, 臺灣園藝學會, 45, 4, 472-472

1999

• 研討會   鄭秋雄*, 利用細胞培養技術進行抗青枯病茄子育種, 中華植病學會年會論文宣讀摘要, 中興大學, 中華民國
• 專書   何婉清等, 何婉清*, 鄭秋雄, 國立屏東科技大學農學院生態學講義, 國立屏東科技大學農學院, 0, ISBN: 平裝

1998

• 研討會   鄭秋雄*, 王淑貞, 火鶴癒傷組織之誘導及其分化培養培養, 中國園藝年會論文宣讀摘要, 台灣大學, 中華民國, 28-28
• 研討會   鄭秋雄*, 徐振權, 洋蔥癒傷組織之誘導增殖及懸浮細胞培養培養, 中國園藝年會論文宣讀摘要, 台灣大學, 中華民國, 34-34
• 研討會   鄭秋雄*, 利用生物技術育種法進行抗綿疫病茄子育種, 財團法人中正農業科技社會公益基金會八十七年研究計畫成果研討會專刊, 中華民國, 147-156
• 專書   屏科大生物技術教學研究群*, 鄭秋雄, 生物技術基礎實驗. 教育部生物技術教育改進計畫, 睿昱出版社, 0, ISBN: 平裝
• 專書   陳滄海*, 陳仁昭, 鄭秋雄, 高屏原住民地區經濟作物病蟲害綜合防治, 行政院原住民委員會, 0, ISBN: 平裝
• 專書   鄭秋雄*, 環境與生態講義, 國立屏東科技大學, 0, ISBN: 平裝

1997

• 期刊   鄭秋雄*, 木瓜葉塊培養及植株再生, 國立屏東科技大學學報, 國立屏東科技大學, 6, 4, 263-272

1995

• 期刊   鄭秋雄*, 池上正人, 綠豆黃化嵌紋病毒複製型DNA之分子選殖及其感染力分析, 植物病理學會刊, 中華植物病理學會, 4, 3, 111-120
• 期刊   鄭秋雄*, 利用細胞培養技術進行抗紫斑病洋蔥育種, 中華植物病理學會刊, 中華民國植物病理學會, 4, 4, 250-250

1991

• 期刊   鄭秋雄*, 池上正人, Inoculation of Cloned DNA of Mung Bean Yellow Mosaic Virus into Non-Host Tobacco Protoplasts, Annals of the Phytopathological Society of Japan , The Phytopathological Society of Japan , 57, 1, 45-48

1988

• 專書   鄭秋雄*, 組織培養在木瓜無病毒苗大量繁殖上之應用(Application of Tissue Culture in Masspropagation of Virus-free Seedlings of Papaya), 日本東京農業大學碩士論文, 0, ISBN: 平裝