2020

• Symposium   郭耀綸*, , , 2020森林資源保存與利用研討會, 台北, 中華民國, 49-54
• Prize   中華林學會109年度「森林學術獎」, 中華林學會, 中華民國
• Journal   郭耀綸*, , , , Relationships of tree species associations with the topography, water availability, and species drought tolerance in the Lienhuachih forest of central Taiwan., Taiwan Journal of Forest Science, 林試所, 35, 2, 121-140

2019

• Symposium   郭耀綸*, , , , , 藉兩項生理性狀評定蓮華池及恆春海岸樹種的耐旱性, 2019森林資源保存與利用研討會, 台北, 中華民國, 21-26
• Symposium   , 郭耀綸*, , , 中華林學會108年度森林資源永續發展研討會, 台北, 中華民國
• Symposium   , , 郭耀綸*, , 中華林學會108年度森林資源永續發展研討會, 台北, 中華民國
• Symposium   , , 郭耀綸*, , 中華林學會108年度森林資源永續發展研討會, 台北, 中華民國
• Symposium   , , , 郭耀綸*, , 中華林學會108年度森林資源永續發展研討會, 台北, 中華民國
• Prize   108年度「行政院農業委員會表彰林業及自然保育有功人士」, 行政院農業委員會, 中華民國
• Prize   指導學生葉定宏參加中華林學會108年度學術論文發表會獲生態保育與水土保持組第三名, 中華林學會, 中華民國
• Prize   指導學生李典澐參加中華林學會108年度學術論文發表會獲育林與生物科技組佳作, 中華林學會, 中華民國
• Prize   指導學生彭世賢參加中華林學會108年度學術論文發表會獲育林與生物科技組第一名, 中華林學會, 中華民國
• Prize   指導學生余尚鈺參加中華林學會108年度學術論文發表會獲海報發表佳作, 中華林學會, 中華民國
• Journal   Shih-Hsien Peng, Hsiang-Hua Wang, 郭耀綸*, Methods for preventing the invasion of Leucaena leucocephala in coastal forests of the Hengchun Peninsula, Taiwan., Taiwan Journal of Forest Science, 34, 2, 99-112
• Journal   Chang Li-Wan, Chiu Shau-Ting, 郭耀綸*, Hsieh Chang-Fu, Lee Pei-Hsuan, Niche Partitioning Affects Spatial Distribution Patterns of three Helicia Species of the Lienhuachih Evergreen Broadleaf Forest, Central Taiwan., Taiwan Journal of Forest Science, 34, 4, 291-303

2018

• Symposium   多納崩塌地耐陰樹種苗木淨光合率與高生長率在不同光環境的表現, 中華林學會107年森林資源永續發展研討會, 台北, 中華民國
• Symposium   , , 香蕉灣海岸林40年來演替位階退化, 中華林學會107年森林資源永續發展研討會, 台北, 中華民國, 8-8
• Symposium   , , , 藉植株長期缺水時的生理表現判斷樹種耐旱性, 中華林學會107年森林資源永續發展研討會, 台北, 中華民國, 16-16
• Symposium   , , , 蓮華池森林山脊上坡分布樹種有較高的葉部耐旱性, 中華林學會107年森林資源永續發展研討會, 台北, 中華民國, 10-10
• Symposium   , , , 恆春海岸林樹種的生理耐旱性, 中華林學會107年森林資源永續發展研討會, 台北, 中華民國, 13-13
• Symposium   , , , , , 蓮華池森林不同坡位分布45樹種的葉部耐旱性比較, 2018森林資源保存與利用研討會, 台北, 中華民國, 13-18
• Prize   指導學生鍾安晴參加中華林學會107年度學術論文發表會獲生態保育與水土保持組第三名, 中華林學會, 中華民國
• Prize   指導學生許展維參加中華林學會107年度學術論文發表會獲海報發表林學組佳作, 中華林學會, 中華民國
• Prize   指導學生江嘉祥參加中華林學會107年度學術論文發表會獲育林與生物科技組佳作, 中華林學會, 中華民國
• Prize   指導學生林倉億參加中華林學會107年度學術論文發表會獲大學組第一名, 中華林學會, 中華民國
• Prize   指導學生余尚鈺參加中華林學會107年度學術論文發表會獲生態保育與水土保持組第一名, 中華林學會, 中華民國
• Journal   Kuo-Chung Tsai, Physiological Drought Tolerance of Tree Species Inhabiting the Ridge of the Kenting Karst Forest, Taiwan Journal of Forest Science, 農委會林業試驗所, 33, 3, 213-230

2017

• Symposium   蓮華池森林不同空間分布樹種的耐旱性, 2017森林資源保存與利用研討會, 臺北, 中華民國
• Symposium   臺灣原生樹種的耐陰性及耐旱性, 前瞻植物生態學研討會, 臺中, 中華民國
• Symposium   海岸樹種台灣海桐、樹青及紅柴耐旱性的比較, 106 年森林資源永續利用研討會, 宜蘭, 中華民國
• Prize   科技部106年度大專校院獎勵特殊優秀人才措施方案獲第二級獎勵, 科技部, 中華民國
• Prize   科技部106年度大專校院獎勵特殊優秀人才措施方案獲第二級獎勵, 科技部, 中華民國
• Prize   指導學生參加中華林學會106年度學術論文發表會獲森林經營與育林組佳作, 中華林學會, 中華民國
• Prize   指導學生參加中華林學會106年度學術論文發表會獲森林經營與育林組佳作, 中華林學會, 中華民國
• Journal   Variations in the predawn leaf water potential and photosynthetic rate during the dry season and drought-tolerance mechanisms of coastal tree species, Taiwan Journal of Forest Science, 32, 2, 131-144

2016

• Symposium   郭耀綸*, 藉葉綠素螢光技術比較不同樹種的葉部耐旱性, 2016光合作用與植物生理研討會, 中華民國
• Symposium   香蕉灣海岸林棋盤腳生態復育作業, 105年森林資源永續發展研討會, 屏東, 中華民國
• Symposium   藉葉綠素螢光技術比較不同樹種的葉部耐旱性, 2016光合作用與植物生理研討會, 台北, 中華民國
• Symposium   蓮華池森林優勢樹種耐旱性與空間分布樣式的關係, 105年森林資源永續發展研討會, 屏東, 中華民國
• Symposium   臺灣五十種原生闊葉樹種的光合潛力及耐陰等級, 2016森林資源保存與利用研討會, 台北, 中華民國
• Symposium   恆春海岸林及蓮華池森林樹種葉部耐旱性比較, 105年森林資源永續發展研討會, 屏東, 中華民國
• Symposium   利用葉片形態及生理參數判斷光合作用率達最大值之葉片, 105年森林資源永續發展研討會, 屏東, 中華民國
• Symposium   , 郭耀綸*, 利用葉片形態及生理參數判斷光合作用率達最大值之葉片, 中華林學會105年森林資源永續發展研討會, 中華民國, 33-35
• Symposium   , , 郭耀綸*, 香蕉灣海岸林棋盤腳生態復育作業, 中華林學會105年森林資源永續發展研討會, 中華民國
• Symposium   , , 郭耀綸*, 蓮華池森林優勢樹種耐旱性與空間分布樣式的關係, 中華林學會105年森林資源永續發展研討會, 中華民國
• Prize   中華林學會105年度年會學術論文發表會, 中華林學會, 中華民國
• Prize   中華林學會105年度年會學術論文發表會, 中華林學會, 中華民國
• Prize   中華林學會105年度年會學術論文發表會, 中華林學會, 中華民國
• Journal   郭耀綸, *, 白鼻心食果習性、棋盤腳更新與墾丁海岸林保育(2012-2015), 華岡農科學報, 38, 69-88

2015

• Symposium   郭耀綸*, , , 臺灣原生闊葉樹種天然更新苗微生育地的相對光量, 2015森林資源保存與利用研討會, 中華民國, 49-51
• Symposium   七種林木在不同季節達最大光合作用率時的葉位, 2015光合作用與植物生理研討會, 台北, 中華民國
• Symposium   , 郭耀綸*, 六種陽性樹種葉片伸展過程葉綠素濃度的變化, 中華學會104年度森林資源永續發展研討會, 嘉義大學, 中華民國, 43-44
• Symposium   , , 郭耀綸*, 林內相對光量標準化及12樹種天然更新苗相對光量之研究, 中華林學會104年度森林資源永續發展研討會, 嘉義大學, 中華民國, 38-39
• Symposium   , , , 郭耀綸*, 墾丁國家公園石珠海岸林銀合歡移除及生態復育之研究, 中華林學會104年度森林資源永續發展研討會, 嘉義大學, 中華民國, 23-25
• Prize   指導學生林易養、邱俊榕參加中華林學會104年度學術論文發表會獲海報發表林學組佳作, 中華林學會, 中華民國
• Prize   指導學生林易養、邱俊榕參加中華林學會104年度學術論文發表會獲海報發表林學組佳作, 中華林學會, 中華民國
• Prize   指導學生彭世賢參加中華林學會104年度學術論文發表會獲育林與生物科技組第一名, 中華林學會, 中華民國
• Prize   指導學生彭世賢參加中華林學會104年度學術論文發表會獲育林與生物科技組第一名, 中華林學會, 中華民國
• Prize   中華林學會104年度年會學術論文發表會, 中華林學會, 中華民國
• Prize   中華林學會104年度年會學術論文發表會, 中華林學會, 中華民國
• Journal   Tzu-Yun Chiu, Hsiang-Hua Wang, 郭耀綸, Kume Tomonori, Wen-Liang Chiou, Yao-Moan Huang*, Ecophysiological characteristics of three Cyathea species in northeastern Taiwan., Taiwan Journal of Forest Science, 30, 3, 147-155
• Journal   郭耀綸*, 葉慶龍, Photosynthetic capacity and shade tolerance of 180 native broadleaf tree species in Taiwan, Taiwan Journal of Forest Science, 30, 4, 229-243
• Journal   郭耀綸*, The impacts of thinning on the fruiting of saprophytic fungi in Cryptomeria japonica plantations in central Taiwan., Forest Ecology and Management, 336, 183-193

2014

• Symposium   郭耀綸*, Photosynthetic capacity and shade tolerance class of 160 native subtropical broad-leaved trees of Taiwan, The International Conference on the 8th Tailand-Taiwan Bilateral Connference, Bangkok, 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, 林木葉片在不同季節達最大光合作用率時的葉齡及葉序, 2014年科技部農業環境科學學門成果發表會, 中興大學, 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, 台灣原生闊葉樹180種的光合潛力及耐陰性分級, 2014森林資源保存與利用研討會, 台北林業試驗所, 中華民國, 33-37
• Symposium   , 郭耀綸*, 賴宜鈴, 南仁湖李氏禾被鋪地黍競爭排擠之探討, 中華林學會103年度森林資源永續發展研討會, 中興大學, 中華民國
• Symposium   , 郭耀綸*, 臺灣原生樹種19種容器苗培育期間生物量分配的變化, 中華林學會103年度森林資源永續發展研討會, 中興大學, 中華民國
• Symposium   , 郭耀綸*, 篩選適用於室內觀賞的台灣原生木本植物, 中華林學會103年度森林資源永續發展研討會, 中興大學, 中華民國
• Symposium   , 郭耀綸*, 林木葉片在不同季節達最大光合作用率時的葉齡及葉序, 中華林學會103年度森林資源永續發展研討會, 中興大學, 中華民國
• Prize   國科會102年度大專校院獎勵特殊優秀人才措施方案, 國科會, 中華民國
• Prize   中華林學會103年度年會學術論文發表會, 中華林學會, 中華民國
• Journal   郭耀綸*, Hsiang-Hua Wang, Shih-Hsien Peng, Ya-Ping Yang, Composition, structure, and preliminary restoration efforts of a tropical coastal forest at Siangjiaowan, southern Taiwan., Taiwan Journal of Forest Science, 29, 4, 267-284

2013

• Symposium   郭耀綸*, , , , , 臺灣珍稀植物臺東蘇鐵的光合作用性狀, 2013光合作用與植物生理研討會, 中華民國, 57-78
• Symposium   , , 郭耀綸*, 臺灣原生樹種四十五種之光合潛力與耐陰性, 中華林學會102年度森林資源永續發展研討會, 中華民國
• Symposium   , , 郭耀綸*, 六種不同耐陰性樹苗生理及生長對光量的馴化, 中華林學會102年度森林資源永續發展研討會, 中華民國
• Prize   101學年度優良導師獎, 屏東科技大學農學院, 中華民國
• Prize   國科會101年度大專校院獎勵特殊優秀人才措施方案, 國科會, 中華民國
• Journal   郭耀綸*, Ming-Kai Huang, 楊月玲, Dynamic variations of photosynthetic capacity in a leaf’s lifetime for tree species at different successional stages., Taiwan Journal of Forest Science, 28, 1, 17-28
• Journal   郭耀綸*, , , , , 東北季風對南仁山區迎風與背風分布樹種苗木的生長與生理活動影響。, 國家公園學報, 23, 2, 43-52
• Journal   , , 郭耀綸*, Growth and photosynthetic responses of understory saplings of three hardwood species to small patch thinning in a Cryptomeria japonica plantation., Taiwan Journal of Forest Science, 28, 3, 113-128
• Journal   , , 郭耀綸*, 恆春熱帶海岸林復舊初期的鼠啃苗木現象, 臺大實驗林研究報告, 27, 4, 285-295

2012

• Symposium   Shih-Hsien Peng, 郭耀綸*, 十二種恆春海岸原生樹種根系分布樣式之研究, 中華林學會101年度森林資源永續經營研討會, 南投, 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, Kai-Shyang Fan, Shih-Hsien Peng, Effect of carbon reduction by reforestation on a coast stand of southern Taiwan, Proceedings of the international symposium on towards a greener asia, Malaysia, 中華民國, 238-241
• Symposium   郭耀綸*, 構樹及血桐葉片存活期間碳收穫與葉壽命的關係, 2012光合作用與植物生理研討會, 台北, 中華民國
• Symposium   , Hsiung-Hua Wang, 郭耀綸*, Ecological restoration on Leucaena leucocephala invaded stands at the west coast of Hengchun, Southern Taiwan, Proceedings of the international symposium on towards a greener asia, Kuala Lumpur, 中華民國, 138-141
• Symposium   , 郭耀綸*, Reproduction phenology and control measures of Leucaena leucocephala at coastal forests of Taiwan, Proceedings of the international symposium on towards a greener asia, Kuala Lumpur, 中華民國, 134-137
• Prize   國科會100年度大專校院獎勵特殊優秀人才措施方案, 國科會, 中華民國
• Prize   中華林學會101年度年會學術論文發表會, 中華林學會, 中華民國
• Journal   , Hsiung-Hua Wang, 郭耀綸*, Effects of soil properties on restoring indigenous plants in coral reef landscapes., Taiwan Journal of Forest Science, 27, 3, 283-298

2011

• Symposium   Kai-Hsiang Fan, 郭耀綸*, 藉挖溝斷根法探討柳杉人工林根系呼吸對土壤呼吸總量之貢獻, 建國百年森林資源永續經營研討會, 宜蘭, 中華民國, 115-124
• Symposium   郭耀綸*, 東北季風影響下林木在型態、生理和生態上的適應, 2010、2011地球科學系統學術論壇, 台北, 中華民國, 53-63
• Symposium   郭耀綸*, , 葉慶龍, 臺灣原生闊葉樹種光合潛力與其天然更新苗光環境的關係, 2011森林資源保存與利用研討會, 中華民國, 91-100
• Symposium   郭耀綸*, , 不同演替階段樹種光合潛力隨葉齡的變化, 2011光合作用研討會, 中華民國, 55-68
• Symposium   , 郭耀綸*, 恆春海岸林外來種銀合歡防治試驗, 建國百年森林資源永續經營研討會, 宜蘭, 中華民國, 45-52
• Symposium   *, 郭耀綸, , , 恆春西海岸生態復育栽植樹種最初兩年之生長表現, 建國百年森林資源永續經營研討會, 宜蘭, 中華民國, 153-162
• Prize   建國百年森林資源永續經營研討會, 中華林學會, 中華民國
• Prize   建國百年森林資源永續經營研討會, 中華林學會, 中華民國
• Prize   國科會99年度大專校院獎勵特殊優秀人才措施方案, 國科會, 中華民國
• Journal   Kuei-Jen Hsieh, 郭耀綸*, Jen-Jiun Perng, Tsung-Chi Lee, Hwei-Ling Lee, Effects of host plant Oviposition Preference and Larval Survival of Troides aeacus formasanus (Lepidoptera: Papilionidae) on Aristolochia zollingeriana in Different Environments., Taiwan J For Sci , 25
• Journal   Ke-Fang Chen, Shu-Hui Wu, Hsiang-Hua Wang, 郭耀綸*, 恆春西海岸生態復育栽植樹苗最初兩年之生長表現, 國家公園學報, 21, 4, 63-72
• Journal   郭耀綸*, Yan-Ping Lee, 楊月玲, Wind effects on stomatal conductances and leaf temperatures of tree seedlings distributing in various habitats of Nanjenshan forests., Taiwan J For Sci, Taiwan Journal of Forest Science, 26, 1, 1-16

2010

• Symposium   Yan-Ping Lee, 郭耀綸*, 風對南仁山不同生育地樹種苗木氣孔導度與葉溫的影響, 森林資源保存與利用研討會, 台北, 中華民國, 49-62
• Symposium   Shih-Hsien Peng, 郭耀綸*, Carbon budgets in seedlings of nine tree species in the lowland rainforest of Nanjenshan, southern Taiwan., XXIII IUFRO World Congress, 首爾, 中華民國, 137-137
• Symposium   Kuei-Jen Hsieh, 郭耀綸*, Jen-Jiun Perng, 墾丁國家公園黃裳鳳蝶族群生態及保育研究, 2010年熱帶林業研討會-森林生物資源保育及利用研討會, 屏東, 中華民國, 56-69
• Symposium   郭耀綸*, 陳海琳, 台灣南部80種闊葉樹種光合作用性狀及其應用, 2010年光合作用研討會, 中興大學, 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, Shih-Hsien Peng, Contribution of sunflecks to photosynthesis in understory seedlings of six tree species in the lowland rainforest of Nanjenshan, southern Taiwan., XXIII IUFRO World Congress, 首爾, 中華民國, 136-136
• Symposium   郭耀綸*, 北季風影響下林木在形態、生理和生態上的適應, 地球科學系統的變遷與災害學術論壇, 台北（文化大學）, 中華民國, 17-17
• Prize   99年度農業氣象個人學術獎, 中華農業氣象學會, 中華民國
• Prize   中華林學會99年度年會學術論文發表會, 中華林學會, 中華民國
• Prize   中華林學會99年度年會學術論文發表會, 中華林學會, 中華民國
• Journal   Wei-Chun Chao, Guo-Zhang M. Song, Kuo-Jung Chao*, Chi-Cheng Liao, Su-Wei Fan, Shan-Huah Wu, Tsung-Hsin Hsieh, I-Fang Sun, 郭耀綸, Chang-Fu Hsieh, Lowland rainforests in southern Taiwan and Lanyu, at the northern border of Paleotropics and under the influence of monsoon wind., Plant Ecol, 210, 1, 1-17
• Book   郭耀綸*, 民族植物利用研討會專刊, 屏東科技大學, 0, ISBN: 957-01-8345-4

2009

• Symposium   郭耀綸*, 墾丁熱帶海岸林原生樹種及銀合歡的生態生理學性狀, 2009年熱帶林業研討會-森林生物資源保育及利用研討會, 屏東, 中華民國, 57-74
• Symposium   郭耀綸*, 光資源對林木生長及光合作用性狀的影響, 種苗與造林技術之研究與挑戰研討會, 台北, 中華民國, 99-118
• Symposium   郭耀綸*, , 風對南仁山不同生育地分布樹種苗木氣孔導度與葉溫的影響, 中華農業氣象學會98年度學術活動, 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, , 風對南仁山不同生育地分布樹種苗木氣孔導度與葉溫的影響, 中華林學會98年度學術論文發表會論文集, 台中市, 中華民國, 69-70
• Symposium   郭耀綸*, , 疏伐後光資源的改變對林下三種樹苗光合作用及生長的影響, 98年光合作用研討會, 台北, 中華民國, 1-14
• Symposium   郭耀綸*, , 斑光對南仁山森林林下六種樹苗光合作用的貢獻, 中華林學會98年度學術論文發表會論文集, 台中市, 中華民國, 71-72
• Symposium   郭耀綸*, , 土壤溫度及土壤含水率對南投柳杉林地土壤呼吸之影響, 中華林學會98年度學術論文發表會論文集, 台中市, 中華民國, 91-92
• Symposium   郭耀綸*, , 南仁山森林林下六種樹苗光合作用對斑光的反應, 中華農業氣象學會98年度學術活動, 台中, 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, , , 疏伐對柳杉人工林土壤呼吸之影響, 2009年自然資源保育暨應用學術研討會, 台北, 中華民國, 414-457
• Journal   H H Wang, SF Hung, 郭耀綸, FH Chen*, 復舊苗木在熱帶海岸林銀合歡防除地之初期生長, 國家公園學報, 19, 1, 9-22
• Journal   楊月玲*, PL Chung, FY Lee, 郭耀綸, , Dynamics of the Photosynthetic Capacity during the Lifetime of Leaves in Three Subtropical Tree Species, Taiwan J For Sci, 24, 3, 159-172
• Journal   郭耀綸*, Tsu-Wei Hwang, 楊月玲, Dynamics of the Photosynthetic Capacity during the Lifetime of Leaves in Three Subtropical Tree Species, Taiwan J For Sci, 24, 3, 159-172

2008

• Symposium   郭耀綸*, 紅藜的栽培與特性介紹, 97年紅藜推廣研習會專刊, 屏東縣, 中華民國, 1-9
• Symposium   郭耀綸*, 中鋼公司廠區灌木及木質藤本植物吸收CO2量評估　, 97年光合作用研討會論文集, 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, , 疏伐對柳杉人工林土壤呼吸作用之影響, 97年度中華農業氣象學會年會暨會員大會, 台中市, 中華民國, 24-24
• Symposium   郭耀綸*, , 三種亞熱帶樹種葉片一生光合作用潛力的動態變化, 林木育種與育林技術研討會, 台北市, 中華民國, 1-19
• Symposium   郭耀綸*, , , 柳杉林疏伐對林下三種闊葉樹碳收穫及生長的影響, 97年度中華農業氣象學會年會暨會員大會, 台中市, 中華民國, 23-23
• Symposium   郭耀綸*, , , 南仁山森林林下九種樹苗的碳收支, 97年度中華農業氣象學會年會暨會員大會, 台中市, 中華民國, 25-25
• Prize   97學年度教學特優獎, 屏東科技大學農學院, 中華民國
• Journal   Yi-Ting Chung, 郭耀綸*, Breeding Season Behaviors and Life History of the Land Crab Discoplax hirtipes in Kenting National Park, 國家公園學報, 內政部營建署, 18, 1, 57-66
• Journal   Tze-Yang Chen, 郭耀綸*, 南仁山迎風與背風分布樹種光合作用對溫度的差異反應, 作物環境與生物資訊, 台灣農藝學會、中華農業氣象學會, 5, 2, 91-100
• Journal   Maja Willis, Stefan Zerbe*, 郭耀綸, Distribution and ecological range of the alien plant species Mikania micrantha Kunth (Asteraceae) in Taiwan, Journal of Ecology and Field Biology, 31, 4, 277-290
• Journal   CY Chung*, , , 郭耀綸, 常見木本植物對二氧化硫之耐性分析, 中華林學季刊, 中華林學會, 41, 3, 339-349
• Journal   郭耀綸*, Shin-Yu Lai, Photosynthetic Characteristics and Plasticity to Light of Seedlings with Different Shade Tolerance in Nanjenshan Forest, 國家公園學報, 內政部營建署, 18, 1, 11-21
• Journal   郭耀綸*, Kj Hsieh, Population Distribution of Aristolochia zollingeriana, an Endangered Vine Exploited by Three Papilionid Butterflies in Kenting National Park in Taiwan, Taiwan J For Sci , 23, 3, 243-254
• Journal   郭耀綸*, JY Chen, Effects of Short-term Fumigation with Sulfur Dioxide on Foliar injury and Physiological Activities in Seedlings of 17 Tree Species, 作物環境與生物資訊, 台灣農藝學會、中華農業氣象學會, 5, 2, 113-126

2007

• Symposium   郭耀綸*, 民族植物紅藜的生物學性狀及栽培方式, 紅藜推廣研習會, 屏東縣, 中華民國, 1-5
• Symposium   郭耀綸*, 墾丁國家公園港口馬兜鈴生育地生態特性及對其族群成長之影響, 中華林學會96年學術論文發表會 論文集(生態組), 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, 四十種樹苗在中鋼公司廠區環境適應性之比較, 林木種苗繁殖栽培與造林技術的新發展研討會論文集, 中華民國, 149-155
• Symposium   郭耀綸*, 南仁山迎風與背風分布樹種光合作用溫度反應的比較, 中華林學會96年學術論文發表會 論文集( 育林組 ), 中華民國, 357-366
• Symposium   郭耀綸*, , 東北季風對南仁山迎風與背風分布樹種苗木形態與生理活動之影響, 中華林學會96年學術論文發表會 論文集( 育林組 ) , 中華民國, 251-260
• Journal   CY Chung*, PL Chung, FY Lee, 郭耀綸, 植物對氮氧化物及硫氧化物淨化效能評估, 中華林學季刊, 40, 4, 497-507
• Journal   郭耀綸*, Effects of Typhoon Disturbances on Understory Light and Seedling Growth of Six Tree Species in Kenting Forest, Southern Taiwan, 台灣林業科學(EI), 林業試驗所, 22, 4, 367-380
• Journal   , 郭耀綸*, Growth and Physiological Responses to Light Environment in Seedlings of Litsea cubeba, Eurya nitida var. nitida, and Cyclobalanopsis longinux, 作物環境與生物資訊, 台灣農藝學會、中華農業氣象學會, 4, 4, 297-306
• Journal   , , 郭耀綸*, Dynamics of short-term regeneration of seedlings and the influence of typhoon in windward forest of Nanjenshan, 國家公園學報, 17, 1, 15-25
• Book   郭耀綸*, 生態學, 美商麥格羅‧希爾公司台北分公司, 1, ISBN: 9789861574202

2006

• Symposium   郭耀綸*, 適用於工業區空氣污染條件樹種之篩選, 第一屆環境保護林經營管理研討會, 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, 南仁山迎風坡森林小苗更新動態, 2006年自然資源保育暨應用學術研討會, 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, 南仁山迎風坡森林天然更新苗的光合作用性狀及其對光量的可塑性, 中華林學會 95年學術論文發表會論文集 , 中華民國, 1029-1037
• Symposium   郭耀綸*, , , 颱風對南仁山迎風森林小苗短期更新動態的影響, 中華林學會95年度學術論文發表會論文集 , 中華民國, 1019-1028

2005

• Symposium   郭耀綸*, Ecophysiological characteristics of windward and leeward tree soecies in Nanjenshan taiwan, XXII IUFRO world congress, 澳洲, 中華民國
• Journal   郭耀綸*, , Photosynthetic Light and Temperature Responses of 4 Rare and Endemic Tree Species in the Nanjenshan Forest, Taiwan, 台灣林業科學(EI), 林業試驗所, 20, 3, 203-214

2004

• Symposium   郭耀綸*, Response of Young Seedlings to the Naturally Enriched CO2 Concentration Neat the Forest Floor in a Lowland Forest of Nanjenshan, Southern Taiwan, International symposium on multilateral cooperation in agricultural biotechnology exchange in Pan-Pacific area, 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, Recent activity of Taiwan Ecological Research Network, The 5th Conferance on East Asia and Pancific Regional Netwok of ILTER, 北京, 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, 高雄縣綠化栽植樹種特性及選定, 高雄縣政府百萬植樹綠化植栽與撫育管理講習會, 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, 高雄縣校園植栽樹種選定及撫育, 高雄縣政府教育局校園植栽規劃與撫育管理講習會, 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, 南仁山森林小葉樟、希蘭灰木、細葉茶梨及烏心石舅之光合作用光反應及溫度反應, 光合作用研討會論文集 , 中華民國, 1-14
• Journal   郭耀綸*, Gas Exchange Potential in Sun-Exposed Leaves of 30 Broadleaf Tree Species in Taiwan, 台灣林業科學(EI), 林業試驗所, 19, 4, 375-386
• Journal   郭耀綸*, , , Growth and Photosynthetic Responses to Light in Rooted Cuttings of Cinnamomum kanehirae, 台灣林業科學, 林業試驗所, 19, 3, 215-224
• Journal   , 郭耀綸*, Soil Seed Bank and Forest Regeneration in a Broadleaf-Coniferous Forest of Dona, Southern Taiwan, 台灣林業科學(EI), 林業試驗所, 19, 1, 33-42
• Journal   , 郭耀綸*, Forest CO2 Gradient and Its Effects on Photosynthetic Characteristics of Understory Seedlings in the Nanjenshan Forest, 台灣林業科學(EI), 林業試驗所, 19, 2, 97-106

2003

• Symposium   郭耀綸*, Recent activities in Taiwan LTER sites 2003.9., International Long Term Ecological Research Network , 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, Ecological Characteristics of Three Invasive Plants Leucaena leucocephala, Mikania micrantha, and Stachytarphetar jamaicensis Thriving in Southern Taiwan 2003.11., Biological invasions- environmental impacts and the development of a database for the Asian-Pacific region, 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, 民族植物與社區文化, 農業生產化、生活化和生態化的挑戰研討會 p 233-244., 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, 林床較高的二氧化碳濃度有利耐蔭種小苗的光合作用 2003.10., 中華林學會92年度學術論文發表會, 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, 小花蔓澤蘭的生態生理性狀 2003.10., 小花蔓澤蘭危害與管理研討會 , 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, 台灣南部二種優勢入侵植物銀合歡及小花蔓澤蘭的生態性狀及防治 2003.10, 入侵種生物管理研討會, 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, 南仁山迎風與背風樹種生態生理學性狀的比較 2003.4., 國家公園保育成果與經營管理研討會, 中華民國
• Symposium   南仁山迎風與背風樹種光合作用最適溫及生產力的比較 2003.9., 光合作用研討會, 中華民國
• Journal   郭耀綸*, 楊月玲, , , 三種台灣特有種樹苗在不同光環境下的淨光合作用季節變化, 18, 林業試驗所, 2, 107-116
• Journal   郭耀綸*, Regeneration Dynamics in a Treefall-Gap within 3 Years in Nanjenshan Forest, 台灣林業科學(EI), 林業試驗所, 18, 2, 143-151
• Journal   郭耀綸*, 台灣南部南仁山迎風與背風分布樹種葉片耐脫水能力及比葉重的比較, 台灣林業科學(EI), 林業試驗所, 18, 4, 283-292
• Journal   郭耀綸*, , 台灣特有樹種台灣假黃楊、小芽新木薑子及台灣梭羅木, 台灣林業科學, 18, 1, 55-66

2002

• Symposium   郭耀綸*, Response of small seedlings to the enriched CO2 environments near the forest floor in Nanjenshan forest of Southern Taiwan 2002.11., 林試所主辦 森林碳吸存及監測國際研討會 論文集 74-76頁., 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, 南仁山森林的光合作用 2002.5., 國立中興大學、奧登堡股份有限公司共同主辦光合作用研討會 台中 論文集, 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, 南仁山森林倒木孔隙內苗木更新的動態變化 2002.10, 中華林學會91年度論文發表會, 中華民國
• Journal   郭耀綸*, 藉連續切蔓法及相剋作用防治外來入侵的小花蔓澤蘭, 台灣林業科學(EI), 林業試驗所, 17, 2, 171-181
• Journal   , 郭耀綸, Robin Rose, *, 氫氧化銅處理的育苗容器對五種本土樹苗生長性狀之效應, 台灣林業科學(EI), 林業試驗所, 17, 4, 515-524

2001

• Symposium   郭耀綸*, High CO2 levels near the forest floor may compensate the light-limited rates of net photosynthesis for understory shade-tolerant seedlings 2001.9., 林試所與國科會主辦的熱帶林業國際研討會 台北 論文集, 中華民國
• Journal   郭耀綸*, 外來入侵種長穗木之個體生態學性狀及相剋作用活動潛力, 台灣林業科學(EI), 林業試驗所, 16, 2, 103-114

2000

• Symposium   郭耀綸*, Explore the ecophyological mechanisms for tree species adapting to different elevations in Nanjenshan, Southern Taiwan 2000.6., 森林多樣性與改變, 中華民國
• Symposium   郭耀綸*, Ecophysiological Studies at the top of a lowland forest canopy in southern Taiwan 2000.8., 第21屆國際林業研究組織全球大會（XXI IUFRO World Congress）, 中華民國
• Journal   郭耀綸*, Photosynthesis of a Tropical Canopy Tree, Ficus benjamina, and Understory Species in a Lowland Rain Forest in Nanjenshan, Taiwan, 台灣林業科學(EI), 林業試驗所, 15, 3, 351-363

1999

• Journal   郭耀綸*, Morphological and Photosynthetic Plasticity to Light Regimes in Seedlings of Six Tropical Tree Species at Kenting, Taiwan, 台灣林業科學, 林業試驗所, 14, 3, 255-273

1998

• Symposium   郭耀綸*, 紅楠、咬人狗及白匏仔苗木在南仁山森林林隙及林下環境的光合作用特性比較, 中華林學會八十七年度年會特刊(摘要）, 中華民國, 74-74
• Symposium   郭耀綸*, 南仁山不同海拔高六種苗木的生態生理研究, 中華林學會八十七年度年會特刊（摘要）, 中華民國, 51-51

1997

• Journal   郭耀綸*, , 黃心柿、毛柿及大葉山欖苗木光合作用與形態對不同光量的可塑性, 中華林學季刊 , 中華林學會, 30, 2, 165-185
• Journal   *, 郭耀綸, , 墾丁高位珊瑚礁森林樹冠疏開對二十種樹木種子發芽的影響, 台灣林業科學, 林業試驗所, 12, 3, 299-307

1995

• Journal   郭耀綸*, 墾丁高位珊瑚礁原始林林下茄苳新生幼苗之族群動態, 林業試驗所研究報告季刊, 林業試驗所, 10, 4, 383-389
• Journal   郭耀綸*, 六種固有景觀樹種苗木之耐蔭性研究, 技術學刊 , 10, 2, 103-109